El Departamento de Química es uno de los once departamentos con los que cuenta Centro de Ciencias Básicas. Es uno de los departamentos más antiguos del centro y apoya a un gran número de carreras, del propio centro y de algunos otros centros académicos. Se fundó a la par que el Centro Básico por lo cual es uno de los de mayor antigüedad en la Universidad. En el año de 1988 el H. Consejo Universitaria aprueba el Plan de Estudios de la que sería la primera carrera bajo la responsabilidad de este departamento: Licenciado en Análisis Químico Biológicos. Este programa educativo vino a tratar de resolver la necesidad social de contar con profesionistas en las áreas de análisis clínicos, industriales y ambientales a nivel local, regional y nacional. Desde el año 2010, se cuenta con un nuevo programa educativo: Licenciado en Biotecnología, el cual viene a responder a la necesidad social de ofrecer alimentos suficientes y de calidad, servicios de salud modernos y al alcance de todos, así como un ambiente limpio, todo esto conservando y haciendo un uso racional de la Biodiversidad. El Licenciado en Biotecnología se ha posicionado como un profesionista con capacidad para resolver problemas aplicando herramientas biotecnológicas y atenderá a las necesidades sociales en los sectores agropecuario, forestal, ambiental, de salud humana y ambiental. Desde sus inicios y hasta hoy en día ambas carreras han demostrado calidad en sus planes de estudio siendo vanguardistas en la actualidad. Recientemente la carrera de Análisis Químico Biológicos sufrió una reestructuración en su plan de estudios para ahora llamarse Químico Farmacéutico Biólogo. El departamento de Química desde su creación hasta el día de hoy las actividades docentes han demostrado calidad en sus áreas de conocimiento asegurando con ello también la calidad de sus programas educativos tanto en los aspectos teóricos como prácticos. Actualmente cuenta con tres academias: Química, Bioquímica y Biología Molecular, las cuales apoyan y establecen las directrices de la formación académica de los alumnos, aunado al apoyo de otros Departamentos del Centro de Ciencias Básicas y otros centros académicos. Recientemente se están realizando las gestiones necesarias para la creación de la academia de Farmacia, con la que se busca impulsar las materias del ramo farmacéutico que se desarrollan en el plan de estudios de Químico Farmacéutico Biólogo. Actualmente se cuenta con 342 estudiantes de la licenciatura en Análisis Químico Biológicos y 148 estudiantes de Licenciado en Biotecnología, siendo un total de 490 alumnos. El Departamento de Química mantiene un personal docente experimentado para la impartición de cursos en la disciplina y atender así a los programas educativos, sin embargo es necesario que esta se renueve continuamente para asegurar la calidad en la impartición de los diversos cursos. Actualmente, el Departamento de Química cuenta con 15 Profesores de Tiempo Completo, 6 Profesores de Medio Tiempo y dos profesores de cátedras CONACYT; siendo uno de ellos recientemente designado al Departamento, así como cinco técnicos académicos de tiempo completo. Además cinco investigadores se encuentran dentro del SNI y nueve cuentan con perfil PROMEP. De los 16 Profesores de Tiempo Completo, ocho cuentan con grado de Doctorado y ocho con Maestría. De los seis Profesores de Medio Tiempo, uno tiene grado de Doctorado y está en el SNI y los otros cinco cuentan con grado de Maestría.